O primeiro presidente do CRM-AP nomeado em caráter transitório pelo Conselho Federal de Medicina (CFM) foi Antônio Tancredi. O médico foi empossado no dia nove de fevereiro de 1959, no salão nobre do antigo Hospital Geral, onde funciona o atual Hospital de Clínicas Dr. Alberto Lima. A primeira diretoria era composta pelos médicos: Juliana Paraense dos Santos, Mário Barbosa, Alberto Lima e Augusto Nilson Pinto, respectivamente secretária, tesoureiro e membros.
O dia 16 de setembro de 1963 foi um marco histórico na história do CRM-AP. Nessa data foi realizada a primeira eleição para membros efetivos e suplentes do Conselho. Dos vinte médicos inscritos, na época, 16 participaram da escolha. Ao meio dia, do dia 30 de janeiro de 1964, no salão nobre do Hospital Geral, a nova diretoria do CRM-AP tomava posse. Os médicos Orlando de Saboya Barros, Juliana Paraense dos Santos, Vicente de Paula Paiva, Alberto da Silva Lima e Jorge Netto da Costa foram eleitos como membros efetivos. Os doutores Edmundo Juarez, Manoel J. de A. Carvalho Brasil, Emília Martins Ventura Picanço, Javan Valle de Melo, José Ribamar Cavalcante de Mello ficaram como membros suplentes.
Presidentes desde sua fundação:
Antônio Tancredi (1959 – 1963- 1974)
Alberto da Silva Lima (1974 – 1983)
Arthur de Lima Torrinha (1983 – 1988)
Jocy de Oliveira Furtado (1988 – 1993)
Raimundo Malcher Pinon Filho (1994 – 1999)
Nelma Rocha Barbosa (1999 – 2003)
Dardeg de Souza Aleixo (2003 – 2008)